本项目针对禽重要肠道疾病防控面临的问题，开展了以下几方面研究内容：一是持续性针对广东地区鸡源和鸽源大肠杆菌、产气荚膜梭菌、沙门氏菌、球虫、隐孢子虫等重要肠道病原的纵向流行规律调查及耐药性监测，建立了广东地区禽源重要肠道疾病流行规律与病原体耐药性信息库，指导临床生产科学合理用药，为新药研制提供数据指导；二是通过生物信息学、代谢组学、结构生物学、组合化学等现代技术手段筛选获得2个药物靶标，揭示了禽重要肠道病原关键代谢酶的作用机制，为肠道重要疾病的高效防控技术与产品研制提供了关键理论支撑。三是建了以药靶为基础的抗菌单体化合物高通量筛选技术和基于球虫细胞培养技术与实时荧光定量PCR相结合的抗球虫先导化合物高通量筛选技术，分别筛选获得抗球虫先导化合物14个，抗菌活性天然化合物9个，在所获得先导化合物的基础指导下，进行合理组方，集成现有技术创制了新兽药山花黄芩提取物散与锦心口服液，获得新兽药证书，并得到广泛的推广应用。