我国养猪业取得举世瞩目成就，但仍存在疾病预防与预报机制不健全、猪病诊断和防治水平较低、诊疗设施简陋、诊断技术落后和技术人员素质有待提高等问题。疾病误诊、不合理用药和免疫失败等现象在猪场还时常出现，致使有些猪病反复暴发和持续流行，进一步加大了经济损失。本项目针对以上问题对全国主要猪病进行流行病学动态监测调查，特别是针对猪繁殖障碍疾病、猪圆环病毒2型、高致病性蓝耳病、猪群流行性腹泻疾病等，了解我国猪病的流行特征，为猪场疾病的爆发提供合理的预防和控制措施。同时，分离鉴定了1621株主要传染病病原菌（毒）株，形成了毒种库和基因库，并进行了标准化整理，获得微生物种质资源平台编号，为生产和科研提供背景清晰的种毒株；广泛筛选效价高、抗原性好的菌毒株作为种毒，获得副猪嗜血杆菌、猪传染性胸膜肺炎放线杆菌、猪细小病毒YBF01 株等抗原性优异的种毒毒株。建立了猪瘟病毒野毒株和兔化弱毒疫苗株RT-PCR-RFLP鉴别检测方法，建立了猪蓝耳病病毒通用RT-PCR检测方法，猪圆环病毒2型TaqMan荧光定量PCR检测方法，PRRSV和PCV2二重PCR检测方法，猪瘟荧光定量RT-PCR检测方法，猪繁殖与呼吸综合征病毒主要结构蛋白基因半定量RT-PCR方法等8种检测技术，为疾病的诊断提供了科学的依据。攻克了毒种选育、病毒浓缩、耐热冻干保护、病毒繁殖等12项疫苗研制及产业化关键技术。相关研究成果达到同类研究的国际领先水平，获得中华农业科技奖二等奖。