1．利用现代手段系统开展了海洋纤毛虫区系、分类学研究，纠正了国际间前人研究中大量的混乱和错误，包括在国际主流刊物发表了200余新目/科/属/种等新阶元； 2.完成了对60余种（具重要地位或不同发生类型）的细胞发生学研究、建立了21个科/属的个体发生模式、阐明了众多未明结构的起源、分化和反分化规律； 3．在基因树构建/分析及个体发生学研究的基础上，解答了包括游仆类、盾纤类等4个目级类群的系统发育、演化关系等国际间悬疑问题； 4．开展了（对我国海水养殖动物的）危害性原生动物病原学和病害学以及近岸环境中原生动物的生态学探讨，填补了国内外该领域研究的若干空白； 5．支撑和引领了我国现代海洋纤毛虫学这一研究领域并形成了具广泛国际影响的系列成果；培养了一批国内外具有一定竞争力的，高层次人才队伍。 当前承担或完成的主要课题 (1) 纤毛虫原生动物的细胞分化与发生模式以及重要海洋类群的分类学与系统构建。国家自然科学基金，2005.1-2008.12，130万元，负责人：宋微波 (2) 海洋近岸环境中浮游生纤毛虫原生动物的多样性及生态学。国家自然科学基金，2004.01-2006.12，30万元，负责人：宋微波 (3) 胶州湾的保护：纤毛虫对环境的生物监测和多样性评估。中英合作达尔文启动计划，2005.4-2009.3,约200万元人民币, 中方负责人：宋微波